Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
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