Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms