Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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