Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
POLEQ07864 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms