Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBQ06643 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LTBQ06643 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LTBQ06643 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LTBQ06643 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LTBQ06643 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LTBQ06643 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LTBQ06643 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LTBQ06643 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LTBQ06643 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LTBQ06643 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
LTBQ06643 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LTBQ06643 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBQ06643 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBQ06643 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBQ06643 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBQ06643 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBQ06643 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBQ06643 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBQ06643 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBQ06643 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBQ06643 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBQ06643 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBQ06643 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBQ06643 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBQ06643 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBQ06643 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms