Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms