Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms