Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL1Q00532 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL1Q00532 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL1Q00532 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL1Q00532 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL1Q00532 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL1Q00532 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL1Q00532 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL1Q00532 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL1Q00532 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL1Q00532 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL1Q00532 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL1Q00532 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL1Q00532 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL1Q00532 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL1Q00532 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms