Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms