Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms