Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF10P55107 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF10P55107 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF10P55107 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF10P55107 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF10P55107 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF10P55107 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF10P55107 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF10P55107 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF10P55107 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF10P55107 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF10P55107 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF10P55107 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF10P55107 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF10P55107 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF10P55107 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF10P55107 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF10P55107 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF10P55107 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF10P55107 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms