Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23BP54727 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms