Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDST1P52848 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NDST1P52848 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDST1P52848 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDST1P52848 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms