Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms