Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL1P40616 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL1P40616 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms