Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms