Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
BMI1P35226 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
BMI1P35226 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
BMI1P35226 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
BMI1P35226 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
BMI1P35226 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
BMI1P35226 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
BMI1P35226 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
BMI1P35226 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
BMI1P35226 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
BMI1P35226 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
BMI1P35226 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
BMI1P35226 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BMI1P35226 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BMI1P35226 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms