Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H1P32780 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms