Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP1P32455 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP1P32455 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP1P32455 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms