Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC8A1P32418 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms