Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms