Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms