Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms