Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms