Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD58P19256 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD58P19256 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD58P19256 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD58P19256 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD58P19256 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD58P19256 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD58P19256 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD58P19256 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD58P19256 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD58P19256 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD58P19256 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms