Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT4P19013 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT4P19013 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT4P19013 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT4P19013 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT4P19013 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT4P19013 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT4P19013 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT4P19013 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT4P19013 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT4P19013 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms