Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

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Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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