Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAV1P15498 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAV1P15498 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAV1P15498 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAV1P15498 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAV1P15498 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAV1P15498 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAV1P15498 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAV1P15498 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms