Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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