Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms