Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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