Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms