Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms