Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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ARL2-SNX15V9GYD0 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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ARL2-SNX15V9GYD0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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