Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms