Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms