Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF8Q9UPP1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms