Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms