Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS11EQ9UL52 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms