Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBE1Q9UJT0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms