Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms