Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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SNX15Q9NRS6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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