Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms