Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms