Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CR2-203ENST00000367059 3877 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PLSCR1-201ENST00000342435 2233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 FGF11-202ENST00000572907 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms