Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms