Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms