Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms