Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LITAFQ99732 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms