Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms